Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms