Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN11Q06124 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms