Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms