Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms