Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2BQ00403 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms