Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms