Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms