Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms