Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms