Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA2P51531 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms