Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms