Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms