Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NESP48681 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NESP48681 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NESP48681 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms