Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ME1P48163 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ME1P48163 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ME1P48163 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME1P48163 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms