Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AFMP43652 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AFMP43652 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AFMP43652 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AFMP43652 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms