Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPD2P43304 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPD2P43304 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPD2P43304 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPD2P43304 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPD2P43304 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPD2P43304 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms