Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MMP12P39900 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MMP12P39900 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MMP12P39900 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MMP12P39900 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MMP12P39900 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP12P39900 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms