Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms