Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPB2P35606 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPB2P35606 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPB2P35606 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms