Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms