Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms