Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms