Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VARSP26640 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VARSP26640 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VARSP26640 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VARSP26640 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms