Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA1P25391 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA1P25391 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA1P25391 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA1P25391 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA1P25391 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA1P25391 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA1P25391 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA1P25391 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms