Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRBP23467 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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