Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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