Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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