Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2CP19387 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms