Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms