Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms