Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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