Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYBBP04839 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms