Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG7O95352 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG7O95352 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG7O95352 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG7O95352 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms