Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGTAO43765 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGTAO43765 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms