Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms