Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COCHO43405 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms