Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TO15178 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TO15178 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TO15178 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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