Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAMP3O14828 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms