Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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