Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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