Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms