Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms