Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms