Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms