Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX8Q9Y5X2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms