Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms