Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RAB23Q9ULC3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RAB23Q9ULC3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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RAB23Q9ULC3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RAB23Q9ULC3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RAB23Q9ULC3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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