Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PNMA3Q9UL41 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms