Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM248Q9NWD8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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