Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms